La SEFIN, de ámbito nacional, fue aprobada por la Dirección General de Política Interior con fecha de 26 de diciembre de 1983 y figura inscrita en el Registro de Asociaciones del Gobierno Civil de Salamanca con el número 581. Por tanto, la SEFIN ha cumplido los cuarenta años de andadura.
Como antecedente más inmediato a la fundación de la SEFIN, se celebró la I Reunión Nacional de Fijación de Nitrógeno, organizada por la Unidad de Fijación de Nitrógeno del Centro de Edafología y Biología Aplicada del Consejo Superior de Investigaciones Científicas en Salamanca, entre los días 8 y 10 de junio de 1983. La iniciativa de la organización de esta Reunión partió de un Comité Organizador encabezado por el Dr. Claudino Rodríguez Barrueco como Presidente. Esta Reunión supuso el primer contacto a nivel nacional de especialistas e interesados en el sugestivo tema de la Fijación de Nitrógeno Atmosférico. Un objetivo primordial de la I Reunión fue inventariar la investigación realizada en España sobre la especialidad, cubriendo aspectos fisiológicos, bioquímicos, microbiológicos, agrícolas, industriales y ecológicos, de los sistemas libres o asociados que realicen dicha función, así como los efectos sobre la misma de otros factores como clima, plaguicidas, etc.
En esta I Reunión se presentaron los Estatutos de funcionamiento de la nueva Sociedad, que fueron elaborados por una Comisión Gestora formada por los Dres. Claudino Rodríguez Barrueco como Presidente, Tomás Ruiz Argüeso como Secretario, Francisco Bermúdez de Castro y Naya como Tesorero, y José Olivares Pascual y Rafael Orive Echevarría como Vocales.